Zajištění soustavy Natura 2000 a provádění samotné péče, managementu, zahrnující různorodá opatření v evropsky významných lokalitách a ptačích oblastech, je finančně nákladným úsilím. V současné době se potřeby předmětů ochrany lokalit soustavy Natura 2000 hradí z několika zdrojů, národních i evropských.
K významným národním zdrojům patří především Program péče o krajinu (PPK), Podpora obnovy přirozených funkcí krajiny (POPFK) a Správa nezcizitelného majetku ve zvláště chráněných územích (MaS). Všechny jmenované dotační tituly zajišťuje, resp. administruje Ministerstvo životního prostředí a zaměřují se na financování konkrétních opatření v krajině. Ze strany Technologické agentury ČR je doplňuje financování podpory výzkumu, vývoje a inovací v oblasti ochrany životního prostředí, zahrnující i soustavu Natura 2000.
Z evropských programů jsou využívány Operační program Životní prostředí (OPŽP), Program rozvoje venkova (PRV), program LIFE, Fondy EHP a Norska a Interreg. Z evropských zdrojů je možné čerpat dotace především na finančně náročnější projekty prováděné na větším území. Administrativní náročnost celého procesu však bývá vyšší.
jsou určeny pro správy národních parků, Agenturu ochrany přírody a krajiny ČR (AOPK ČR) a Správu jeskyní ČR. V případě POPFK mohou v podprogramu Zajištění povinností orgánů ochrany přírody ve zvláště chráněných územích (vč. ochranného pásma) a lokalitách soustavy Natura 2000 žádat o dotaci stejní žadatelé, v podprogramu Péče o zvláště chráněné druhy rostlin a živočichů jen AOPK ČR a správy národních parků. Výše podpory u všech dotačních titulů může dosahovat až 100 %.
Nejvyužívanějším dotačním národním titulem pro účely podpory předmětu ochrany lokalit soustavy Natura 2000 a obecně chráněných území je PPK A. V roce 2019 se z něj uhradila opatření za více než 116 milionů korun. PPK A financuje vyhotovení dokumentace pro plánování péče, zeměměřické práce, technická zařízení (např. informační tabule nebo značení), dále opatření k odstranění dřívější negativní činnosti v území (např. odstranění nepovolených drobných skládek odpadu, likvidace nepůvodních druhů) a management (nejčastěji sečení, likvidace nežádoucích křovin a dřevin, pastva nebo péče o lesní porosty). Z programu je možné financovat také pravidelný management pro udržení dlouhodobě příznivého stavu území.
je možné financovat zpracování dokumentace pro plánování péče, podklady spojené s vyhlašováním lokalit, značení, management a provoz informačních a návštěvnických středisek. Podporována je příprava a realizace záchranných programů, programů péče a regionálních akčních plánů, tedy významných koncepčních materiálů v oblasti druhové ochrany. V roce 2019 bylo z POPFK pro tyto účely čerpáno více než 20 milionů korun.
MaS vznikl pro financování opatření prováděných na pozemcích vlastněných státem, které leží v chráněných územích, včetně soustavy Natura 2000. Program umožňuje vykonávat rovněž činnosti spojené se správou drobných vodních toků (zajišťují například správy národních parků). MaS podporuje zpracování dokumentace pro plánování péče, údržbu a budování technických objektů (značení, informační tabule apod.), opatření k odstranění dřívější negativní činnosti v území (např. odstranění nepovolených drobných skládek odpadu, nepůvodních druhů), management (péče o lesní porosty, snížení hustoty rybí osádky v rybnících apod.). V roce 2019 bylo na různá opatření vyplaceno 25 milionů korun.
Důležitým programem Technické agentury ČR v oblasti výzkumu pro podporu soustavy Natura 2000 je Program prostředí pro život, jehož Podprogram 5, Biodiverzita, ochrana přírody a krajiny, se věnuje zvyšování kvality a odbornosti péče o území soustavy Natura 2000. Příjemci dotace mohou být podniky a výzkumné organizace.
Velmi využívaným evropským dotačním programem v ochraně přírody je Operační program Životní prostředí (OPŽP), jehož programové období v současném roce končí. Podpoře soustavy Natura 2000 je určena prioritní osa 4, oblast 4.1 Zajištění příznivého stavu předmětu ochrany národně významných chráněných území (zahrnuje též evropsky významné lokality a ptačí oblasti). Nyní probíhá 142. výzva s alokovanou částkou 100 mil. Kč. Žádosti lze podávat od 2. března 2020 do 11. ledna 2021.
O dotaci mohou žádat například kraje, AOPK ČR, správy národních parků, obce, příspěvkové organizace, podnikatelské subjekty i fyzické osoby. Úplný výčet subjektů a podporovaných opatření je obsažen v Pravidlech pro žadatele a příjemce podpory v Operačním programu Životní prostředí pro období 2014–2020. Podpora může dosahovat i 85 %, 90 % nebo 100 %, a to v závislosti na typu opatření a žadateli.
OPŽP podporuje mimo jiné značení lokalit, zeměměřické práce, zpracování dokumentace pro plánování péče a obnovní management, který vede ke zlepšení stavu lokality (zlepšení stavu stanoviště, druhu apod.) a končí ve chvíli, kdy je tohoto cílového stavu dosaženo. OPŽP nehradí činnosti spojené s udržením cílového stavu – v takovém případě se mohou následně uplatňovat programy využitelné pro zajištění udržitelnosti, jako je například PPK.
je dotační titul spravovaný Ministerstvem zemědělství, který cílí na zemědělskou produkci i na podporu biodiverzity a udržitelné využívání zdrojů. V případě podpory biodiverzity se zaměřuje na zemědělské subjekty hospodařící v územích soustavy Natura 2000. Zemědělci jsou podporováni v hospodaření, které je šetrné k předmětům ochrany soustavy Natura 2000. Jedná se o omezení zemědělského hospodaření (konkrétně omezení hnojení – na území národních parků pouze hnůj a kompost, v 1. zónách chráněných krajinných oblastí bez použití hnojiv), o ošetřování travních porostů podporující předmět ochrany soustavy Natura 2000 (určitý typ stanoviště či chráněný druh – konkrétně se jedná například o péči o mezofilní a vlhkomilné louky, trvale podmáčené a rašelinné louky, ochranu modrásků nebo chřástala polního) nebo zachování optimální dřevinné skladby lesů. Dotace se obvykle poskytuje na plochu, kde se opatření provádí, nebo jako kompenzace ušlého zisku. O výši podpory rozhoduje Ministerstvo zemědělství.
podporuje cílová stanoviště a druhy chráněné v rámci soustavy Natura 2000 v prioritní oblasti Příroda a biodiverzita. V České republice bylo do července 2019 podpořeno 13 projektů, kterým Evropská unie přidělila 24 milionů eur, a které se většinou zaměřovaly na podporu chráněných území a druhů. Program LIFE podporuje mezinárodní spolupráci a přenositelnost výstupů projektů po celé EU. Výše podpory je 60 %, případně 75 % za podmínky, že je alespoň polovina celkových způsobilých výdajů tradičního projektu (viz níže) určena na přímá opatření vedoucí ke zlepšení stavu ochrany prioritních stanovišť nebo druhů.
Žadatelé mohou podat žádosti na Evropskou komisi pro podporu tzv. tradičních projektů (nabízí řešení konkrétního environmentálního problému na určitém zvoleném území) či územně rozsáhlejších integrovaných projektů, které naplňují Prioritní akční rámec pro soustavu Natura 2000 (jedná se o strategický materiál členského státu EU vypracovaný za účelem identifikace nákladů nezbytných pro naplňování evropských směrnic v ochraně přírody). Způsobilými žadateli pro tradiční projekty jsou veřejné subjekty (např. města), soukromé podnikatelské subjekty, svazy a veřejné výzkumné instituce a další. O podporu integrovaných projektů mohou žádat národní orgány v oblasti životního prostředí (např. Ministerstvo životního prostředí, krajské úřady).
Obecně klade program LIFE důraz na vysokou odbornou úroveň projektů a jejich evropsky přidanou hodnotu, která jako jedna z hodnotících kritérií vypovídá o přispění projektu k naplňování cílů a priorit Programu LIFE, jeho očekávaném dopadu a udržitelnosti výsledků projektu. Každý podaný projekt se porovnává s již uskutečněnými projekty shromážděnými v rozsáhlé databázi. Vždy se tak hodnotí inovativnost nově podávaného projektu. Celý proces od podání konceptu, jeho případného schválení, podání a schválení samotné žádosti je časově náročný.
I proto vyhlašuje Ministerstvo životního prostředí, které je národním kontaktním místem programu LIFE, každoročně od roku 2015 Národní výzvu LIFE pro tradiční projekty. Výzva je vždy zveřejněná na internetových stránkách Ministerstva životního prostředí, Národní výzva LIFE 2020. Výzva je určena na zajištění spolufinancování projektů pro hlavního žadatele i pro partnery projektu. Dále může žadatel získat finanční prostředky na přípravu projektové žádosti dle stanovených podmínek pro každou výzvu.
Každá následující národní výzva LIFE reflektuje požadavky Evropské komise na program LIFE. Cílem je poskytnout českým žadatelům co největší podporu pro zpracování projektové žádosti a v rámci hodnocení poskytnou maximální zpětnou vazbu pro kvalitní dokončení žádosti, které budou předkládány do evropské výzvy LIFE.
K tomu byl zřízen tzv. hodnotící panel složený z odborníků pro jednotlivé oblasti (externí odborníci, odborníci z řad pracovníků MŽP) podle zaměření projektů a současně z odborníků, kteří dohlížejí na formální zpracování předložených projektů z pohledu požadavků programu LIFE zejména s důrazem na evropsky přidanou hodnotu.
Hodnotícího panelu se mohou zúčastnit sami žadatelé, a získat tak zpětnou vazbu a informace, jak mohou či dokonce by měli zapracovat na samotném projektovém návrhu zejména z pohledu konkrétních potřeb a priorit ochrany přírody a biodiverzity.
podporují soustavu Natura 2000 svým programem Životní prostředí, ekosystémy a změna klimatu (oblast 1. Zlepšování stavu životního prostředí v ekosystémech). Pro aktuální období (2014–2021) je alokováno přibližně 800 milionů korun. Program podporuje inovativní přístupy v ochraně životního prostředí, aplikaci výsledků odborných výzkumů a ochranu ohrožených druhů uvedených na červených seznamech. Dotace je poskytována maximálně do výše 90 % nebo 100 % z celkových způsobilých výdajů projektu. Příjemcem podpory může být jakákoliv právnická osoba se sídlem v České republice.
představují evropské dotační programy určené ke zmírňování rozdílů mezi regiony. Přispívají k regionálnímu rozvoji, čehož je dosaženo například sdílením a výměnou zkušeností. V souvislosti se soustavou Natura 2000 se Interreg zaměřuje na ochranu druhů, které se vyskytují na obou stranách.
Pro financování soustavy Natura 2000 jsou využívány především přeshraniční bilaterární spolupráce dvou zemí. Pro daný program je vymezeno konkrétní území, které zahrnuje příslušné hraniční regiony obou zemí, kde se projekt musí uskutečnit. Řešiteli projektu jsou vždy zástupci z obou zemí, na jejichž území je projekt realizován. Každý program má řídící orgán a národní orgán, které jsou zastoupeny oběma zeměmi. Podobu dotačního programu si určují partnerské země.
Česká republika se doposud zapojila do těchto bilaterárních programů: Interreg V-A Česká republika – Polsko, Interreg V-A Rakousko – Česká republika, Interreg V-A Slovenská republika – Česká republika, OPPS Česká republika – Svobodný stát Bavorsko, OPPS Svobodný stát Sasko – Česká republika.
Kromě výše uvedených bilaterálních vznikají i tzv. velké programy Interreg, kterých se účastní tři a více zemí. Patří sem například Ingerreg Danube a Interreg Central Europe. Zaměřují se především na strategické plánování v ochraně přírody.
Zvláštní kategorií financování ochrany přírody představují náhrady újmy. Tato náhrada náleží nájemci či vlastníkovi pozemků, které leží v zvláště chráněném území, evropsky významné lokalitě či ptačí oblasti, kde dochází ke ztížení lesního nebo zemědělského hospodaření či hospodaření na rybnících s chovem ryb nebo vodní drůbeže. To nastává ve chvíli, kdy je vlastník nebo nájemce omezen v hospodaření na svém pozemku z důvodu ochrany přírody. Může se jednat například o omezení těžby dřeva kvůli zachování optimální dřevinné skladby přírodního stanoviště či požadavek na jeho ponechávání po těžbě k rozpadu a zetlení, při zemědělském hospodaření může omezení vyplynout například z potřeby mozaikovité seče za účelem ochrany hmyzích druhů. Náhrada je vyplácena za uplynulý kalendářní rok zpětně a nahrazuje ušlý zisk. Žádosti vyřizují místně příslušné správy národních parků a regionální pracoviště AOPK ČR.
Národní programy: www.dotace.nature.cz
Program Prostředí pro život, Technologická agentura ČR: www.tacr.cz/program/program-prostredi-pro-zivot
Operační program životní prostředí: www.opzp.cz
Program rozvoje venkova: eagri.cz
Unijní program LIFE: www.program-life.cz a ec.europa.eu/easme/en/life
Norské fondy: www.sfzp.cz/dotace-a-pujcky/norske-fondy
Interreg: www.crr.cz
Náhrada újmy: www.nature.cz